泡发后的木耳隔夜后不建议食用。木耳泡发后容易滋生细菌和毒素，存放不当可能导致食物中毒。
木耳属于菌类食材，泡发后质地柔软且含水量高，为微生物繁殖提供了有利条件。室温环境下放置超过4小时的泡发木耳，细菌会快速繁殖并产生米酵菌酸等有害物质，即使高温烹煮也难以完全破坏这些毒素。泡发木耳最好现泡现吃，若需保存应控干水分后密封冷藏，且冷藏时间不宜超过24小时。
部分人认为冷藏可以完全抑制细菌生长，但家用冰箱温度波动较大，无法彻底阻止耐低温微生物的活性。尤其是夏季高温季节，即使用保鲜膜密封冷藏，木耳表面仍会形成肉眼不可见的菌落。若发现隔夜木耳出现黏液、异味或质地变软塌陷，必须立即丢弃。
日常食用木耳应注意控制单次泡发量，避免剩余。泡发时使用干净容器和饮用水，烹饪前用流水充分冲洗。出现腹痛、腹泻等疑似中毒症状应及时就医，特殊人群如孕妇、儿童及免疫力低下者更需谨慎。合理储存食材是预防食源性疾病的重要环节。
