菠萝蜜扒皮可以先用刀切开表皮，再用手或工具剥离果肉。处理时建议戴手套避免黏液沾手，成熟度高的菠萝蜜更容易剥离。
菠萝蜜外皮坚硬且带有黏液，直接用手剥容易弄脏且费力。准备一把锋利的刀，将菠萝蜜纵向切开成两半，此时会看到白色黏液渗出。用食用油涂抹刀具和双手可以减少黏液附着，切开后能看到内部黄色果肉包裹着白色丝状物。果肉与核心连接处有较大种子，需用刀尖小心剔除。未完全成熟的菠萝蜜果肉较难分离，可放置几天待其变软再处理。
部分品种的菠萝蜜黏液分泌较多，处理时可先用盐水浸泡刀具和双手。若黏液不慎接触皮肤，可用食用油搓洗后再用肥皂清洁。冷藏后的菠萝蜜果肉更易完整取出，但低温会导致黏液变硬增加清理难度。对于体积较大的菠萝蜜，可先切分成小块再逐层剥离，注意果肉中可能残留的坚硬纤维会影响口感。
处理后的菠萝蜜果肉需尽快食用或冷藏保存，避免氧化变质。建议将果核洗净煮熟后食用，富含淀粉和矿物质。日常食用每次控制在200克以内，糖尿病患者应减少摄入量。若对热带水果过敏，首次尝试需观察是否有皮肤发红或咽喉不适等反应，过敏体质者慎食。
