柠檬水的保质期一般为1-3天，实际保存时间受到制作方式、储存条件、添加成分、容器材质、环境温度等多种因素的影响。
1、制作方式
鲜榨柠檬水因含有天然果肉和活性成分，容易滋生微生物，常温下仅能保存4-6小时。煮沸杀菌后的柠檬水或使用无菌工艺制作的瓶装柠檬水，未开封时可保存较长时间，开封后仍需冷藏并在48小时内饮用完毕。
2、储存条件
冷藏保存的柠檬水可延长保质期至2-3天，需密封避免串味。冷冻保存的柠檬冰砖可存放1个月，但解冻后口感会变差。常温放置的柠檬水超过8小时即可能变质，尤其夏季高温环境下更容易腐败。
3、添加成分
添加蜂蜜或糖分的柠檬水因高渗透压环境可抑制部分细菌，冷藏条件下能保存2天左右。含乳制品的柠檬饮品保质期更短，建议24小时内饮用完毕。商用防腐剂处理的柠檬饮料可按包装标注日期保存。
4、容器材质
玻璃容器密封性较好，能减少氧化和异味吸附，适合保存柠檬水。不锈钢容器需注意酸性腐蚀，塑料容器可能释放有害物质，均建议短期存放。使用带盖密封瓶并定期清洁消毒可适当延长保质期。
5、环境温度
25℃以下阴凉环境可保存12小时左右，30℃以上高温环境会加速变质。外出携带时建议使用保温杯并加入冰块，4小时内饮用完毕。反复从冰箱取用会导致温度波动，增加变质风险。
建议每次制作柠檬水时控制分量，现制现饮最能保留营养和风味。储存时注意观察是否出现浑浊、絮状物或异味，变质柠檬水可能含有致病菌，切勿继续饮用。日常可选择新鲜柠檬现泡，或使用干燥柠檬片替代，既方便保存又能避免浪费。饮用柠檬水后建议清水漱口，减少酸性物质对牙釉质的侵蚀。
