泡发过多的木耳可冷藏保存2-3天或冷冻保存1个月，关键需控干水分并密封隔绝空气。
木耳泡发后若未及时食用，需沥干表面水分后用保鲜盒或密封袋分装。冷藏保存时建议垫厨房纸吸收冷凝水，避免细菌滋生导致变质，冷藏期间每日检查是否有黏液或异味。冷冻保存前可将木耳分成小份平铺于保鲜袋，解冻后口感稍软但仍适合炖煮类菜肴。
泡发木耳不宜室温存放超过4小时，尤其夏季高温环境易滋生米酵菌酸等毒素。若发现木耳体积膨胀超过干品5倍、手感黏滑或散发酸腐味，必须立即丢弃。反复解冻会破坏木耳细胞结构，建议冷冻前按单次用量分装。干木耳重新晾晒后虽可延长保存，但营养和口感会显著下降。
日常建议根据食用量分批泡发木耳，每次冷水泡发3-4小时即可完全舒展。保存期间避免接触油脂和生肉，使用前需再次焯水处理。特殊人群如消化功能较弱者，建议选择新鲜银耳等更易保存的菌类替代，同时注意菌菇类食物每日摄入量不宜超过100克，避免膳食纤维过量引发胃肠不适。
