毛豆与高嘌呤食物、高草酸食物、富含单宁酸的食物、寒性食物以及部分药物同食可能影响营养吸收或加重身体负担。毛豆营养丰富，但搭配不当可能引发胃肠不适或干扰药物效果。
毛豆含有较高的嘌呤成分，与动物内脏、浓肉汤等高嘌呤食物同食可能增加尿酸生成，痛风患者需特别注意。毛豆中的草酸易与钙质结合形成沉淀，与菠菜、竹笋等高草酸食物大量同食可能影响钙吸收。毛豆蛋白质与茶叶、柿子中的单宁酸结合会产生不易消化的复合物，可能引起腹胀或消化不良。从中医角度，毛豆性凉，与螃蟹、苦瓜等寒性食物同食可能加重脾胃虚寒者的腹泻症状。部分降压药或抗凝药与毛豆同食可能影响药效，服药期间需咨询
建议健康人群适量食用毛豆并注意搭配均衡，消化功能较弱者可选择充分煮熟的毛豆以减少胀气风险。烹饪时搭配姜、蒜等温性调料能中和寒性，避免空腹大量食用。特殊体质或慢性病患者应结合自身情况调整饮食，出现不适及时就医。日常储存毛豆时需冷藏保鲜，发芽或变质的毛豆禁止食用。
