豆腐第二天有点发臭通常不建议食用。豆腐变质后可能滋生有害微生物，食用后容易引发胃肠不适。若豆腐仅轻微酸味但未发黏变色，高温烹煮后或可食用，但存在风险。
豆腐在储存过程中容易受到细菌污染，尤其是含水量高的嫩豆腐。当豆腐表面出现黏液、颜色发黄或散发明显臭味时，说明蛋白质已分解产生胺类物质，此时食用可能引发腹痛腹泻等食物中毒症状。夏季室温存放超过4小时的豆腐更容易变质，即使冷藏保存超过2天的豆腐也需谨慎检查。
部分发酵豆腐制品如臭豆腐具有特殊气味，但人工发酵与自然腐败有本质区别。若误食变质豆腐后出现恶心呕吐，可适量饮用淡盐水补充电解质，必要时需就医处理。日常建议将豆腐浸泡于煮沸冷却的盐水中冷藏，可延长保鲜期至3天左右。
购买豆腐时应选择质地均匀、气味清香的当日产品，开封后尽快食用。储存时须用干净容器密封，避免与其他生鲜食材接触。老年人、儿童及胃肠功能较弱者更需注意豆腐新鲜度，轻微异味即应丢弃，切勿为节约而冒险食用变质食品。
