喝咖啡在适量饮用时有助于提神醒脑和促进代谢，但过量摄入可能导致心悸失眠或胃肠不适，主要影响涉及神经兴奋、心血管反应、消化功能、骨骼健康及睡眠质量。
咖啡中含有的咖啡因能阻断腺苷受体从而提升大脑警觉性，帮助缓解疲劳感并缩短反应时间，同时其含有的绿原酸等抗氧化物质有助于清除体内自由基，对维持细胞健康有一定益处，此外咖啡还能刺激胃酸分泌增强胃肠蠕动，对于部分便秘人群可起到辅助排便作用，适度饮用还能暂时提高基础代谢率，帮助消耗多余热量，对于需要集中注意力工作或学习的人群而言，适量饮用能提供良好的精神状态支持。
过量饮用咖啡会导致中枢神经过度兴奋引发焦虑紧张情绪，甚至出现手抖心慌等躯体化症状，高浓度咖啡因会加快心率并可能引起血压短暂升高，对已有心脏基础疾病者存在潜在风险，咖啡酸性成分持续刺激胃黏膜可能诱发胃痛反酸或加重胃溃疡病情，长期大量摄入会影响钙质吸收增加骨质疏松概率，尤其对绝经后女性更为明显，晚间饮用容易干扰褪黑素分泌导致入睡困难或睡眠浅易醒，破坏正常生物钟节律，部分人群空腹饮用还可能出现恶心呕吐等急性胃肠反应。
日常饮用咖啡应控制在每日两杯以内，避免空腹或睡前饮用，选择添加少量牛奶或植物奶以中和酸性，保持规律作息配合均衡饮食，若出现持续心慌胃痛或睡眠障碍应及时减少摄入量并咨询专业医师意见，特殊人群如孕妇高血压患者及青少年群体更需谨慎对待咖啡因摄入。