酸奶在餐后1-2小时或两餐之间饮用效果较好。酸奶的饮用时间主要与胃肠吸收、钙质利用、益生菌活性等因素相关。
餐后1-2小时胃酸浓度降低，此时饮用酸奶可减少胃酸对益生菌的破坏，有利于活菌顺利到达肠道发挥作用。酸奶中的乳酸还能促进餐后食物消化，缓解饱胀感。对于乳糖不耐受人群，此时饮用可减轻胃肠不适。搭配水果或坚果食用能延缓血糖上升，增强饱腹感。
空腹时胃酸分泌旺盛，可能降低益生菌存活率，但若需快速补充能量或蛋白质，少量饮用无糖酸奶亦可。夜间饮用需注意选择低糖品种，避免热量过剩。运动后30分钟内饮用有助于蛋白质吸收，但需增肌人群建议搭配碳水化合物。
选择酸奶时优先关注活菌数量与配料表，避免含糖量过高产品。日常可搭配燕麦、蓝莓等食材丰富营养，乳糖不耐受者可选无乳糖酸奶。注意酸奶不能替代正餐，长期存放需冷藏保存以维持活性，开封后建议24小时内饮用完毕。特殊人群如糖尿病患者应控制摄入量，胃炎发作期暂缓食用。