绿豆芽冻过后如果没有变质一般可以吃，但口感会变差且营养可能流失。若出现发黏、变色或异味则不建议食用。
绿豆芽冷冻后细胞结构会被冰晶破坏，解冻后质地变软且汁液渗出。这类豆芽适合快速焯水后用于炒菜或煮汤，高温烹饪能减少水分析出带来的口感影响。冷冻豆芽的维生素C和部分B族维生素含量会下降，但膳食纤维和矿物质相对稳定。短期冷冻保存的豆芽在充分加热后食用通常不会引起健康问题，但需确保冷冻前豆芽新鲜且包装密封。
长时间冷冻或反复解冻的豆芽更容易滋生细菌，芽体发黄或表面黏液是腐败的典型表现。部分人群胃肠功能较弱时，食用冷冻豆芽可能出现腹胀不适。若豆芽冷冻超过两周或包装袋内有冰晶反复融化痕迹，其安全性会显著降低。工业化生产的速冻豆芽因有专业杀菌工艺，保存期限相对更长。
日常建议优先食用新鲜豆芽，冷冻保存不宜超过三天。食用前需观察芽体是否完整，烹调时彻底加热至失去生味。将豆芽与姜丝、蒜末等辛香料同炒有助于提升风味，脾胃虚寒者可搭配少量胡椒粉驱寒。保存时用厨房纸吸干水分后装入密封袋，排出空气后平铺冷冻能延缓品质下降。