柠檬存放在阴凉干燥处或冰箱冷藏室可延长保存时间。保存方法主要有保持干燥、避免挤压、控制温度、隔绝空气、分装处理等。
一、保持干燥
柠檬表皮潮湿容易滋生霉菌导致腐烂。存放前需用干布擦净表面水分，潮湿环境下可用厨房纸包裹吸收水汽。若发现表皮出现霉斑应立即取出避免污染其他水果。
二、避免挤压
柠檬受到外力挤压会破坏细胞结构加速变质。储存时应单层平放于透气的果篮或纸盒中，不可堆叠过高。运输过程中可用泡沫网套保护，与坚硬物品分开放置。
三、控制温度
常温保存选择通风阴凉处避免阳光直射，夏季建议放入冰箱冷藏室蔬果保鲜格。完整柠檬在12℃左右环境中可存放较长时间，切开的柠檬需用保鲜膜包裹冷藏并尽快食用。
四、隔绝空气
将柠檬密封保存能有效延缓氧化。可使用食品级密封袋抽真空存放，或置于密封罐中垫上吸水纸。已切开的柠檬断面可蘸取少量柠檬汁后再密封，减少与空气接触面积。
五、分装处理
大量柠檬可切片冷冻保存，平铺在保鲜袋中避免粘连。柠檬皮可晒干制成调味料，果肉榨汁后冷冻成冰块。不同保存方式需标记日期，建议冷冻保存不超过三个月。
日常食用柠檬时可优先选择表皮光滑紧实的果实，表面有蜡质的商业柠檬保存期更长但建议去皮食用。冷藏保存的柠檬若出现表皮发软、异味或霉变应立即丢弃。将柠檬与苹果、香蕉等乙烯释放量大的水果分开存放，可减缓成熟速度。定期检查储存情况，合理规划使用顺序能最大限度保留营养成分，柠檬中的维生素C和抗氧化物质会随储存时间延长而流失，建议两周内食用完毕。