蘑菇可以放在冰箱冷藏，但需注意储存方式和时间。新鲜蘑菇在低温环境下能延缓腐败，但湿度过高或密封不当易导致变质。
新鲜蘑菇含有较高水分，冷藏时建议用透气性好的纸袋或保鲜盒存放，避免直接接触冰箱内壁。温度控制在2-4摄氏度可保存3-5天，部分品种如香菇、平菇耐储性较强。冷藏前无须清洗，表面泥土可用软刷轻扫，潮湿环境会加速菌褶变黑或发黏。
部分特殊品种如松茸、牛肝菌等风味物质易受低温破坏，短期冷藏后可能出现木质化或香气流失。这类蘑菇更适合用厨房纸包裹后置于阴凉通风处，2日内食用完毕。若发现蘑菇表面出现黏液、异味或菌盖软烂，应立即丢弃。
日常储存蘑菇时需定期检查状态，避免与其他气味强烈的食物混放。烹饪前再清洗可减少水分残留，焯水或快速煸炒能更好保持口感。若需长期保存，可切片烘干或冷冻处理，但冷冻后的蘑菇更适合炖煮类菜肴。