毛豆煮不熟可能含有毒素，建议充分煮熟后食用。未煮熟的毛豆中含有皂苷、植物凝集素等天然抗营养因子，可能引起胃肠不适。
毛豆中的皂苷在高温下可分解，但若未彻底煮熟，可能刺激消化道黏膜，导致恶心、呕吐或腹泻。植物凝集素会干扰营养吸收，充分加热能使其失活。部分人群对未熟豆类更敏感，儿童或消化功能较弱者需特别注意。
野生或储存不当的毛豆可能携带霉菌毒素，即使煮熟也难以完全去除。发芽变质的毛豆会产生更高浓度的有害物质，需直接丢弃。烹饪时建议水沸后继续煮15分钟以上，确保豆荚和豆粒完全软化，避免快速焯水或凉拌生食。
日常食用毛豆应选择新鲜饱满的豆荚，烹饪前彻底清洗。搭配富含维生素C的蔬菜水果有助于提高铁的吸收率。若食用后出现头晕、腹痛等异常反应，应立即停止进食并就医。储存时置于阴凉处，避免潮湿环境导致霉变。