马蹄煮水一般不需要削皮，但需彻底清洗干净。马蹄皮含有部分营养成分，但可能残留泥土或微生物，建议根据食用需求和个人习惯决定是否去皮。
马蹄皮富含膳食纤维和抗氧化物质，带皮煮水有助于保留更多营养成分。煮制前需用流动清水反复刷洗表面泥沙，必要时可用软毛牙刷辅助清洁。若追求更清澈的汤水或给消化功能较弱者饮用，可削去外层褐色硬皮，保留内部白色果肉。带皮煮制时建议延长煮沸时间至15分钟以上，确保有效杀菌。
部分特殊情况下建议去皮处理，如马蹄表皮存在明显霉斑或机械损伤，或用于婴幼儿辅食制作。马蹄皮中草酸含量较高，肾功能异常人群应避免长期饮用带皮煮制的水。若选择保留外皮，饮用前建议用滤网过滤，避免摄入煮制过程中脱落的细小皮屑。
马蹄煮水后建议当日饮用完毕，避免隔夜存放。体质虚寒者可加入少量生姜片中和寒性，糖尿病患者需控制饮用频率。选择新鲜饱满、无腐烂的马蹄，冷藏保存不超过一周。若饮用后出现腹胀等不适，可暂停食用并咨询医师。