红甜椒生吃或熟吃各有优势，具体选择需根据营养需求和消化能力决定。生吃能保留更多维生素C和酶类，熟吃则有助于β-胡萝卜素吸收且更易消化。
红甜椒生吃时，其维生素C含量几乎不受损失，同时保留了天然酶类活性，有助于促进消化和抗氧化。脆嫩口感适合凉拌或沙拉，但可能刺激胃肠黏膜，消化功能较弱者可能出现腹胀。表皮纤维素较硬，牙齿敏感人群需谨慎。生吃还能最大限度保留水溶性维生素B族，但脂溶性营养素吸收率较低。
红甜椒经过加热后细胞壁软化，β-胡萝卜素生物利用率提升数倍，尤其适合与油脂搭配烹饪。炖煮或烘烤会损失部分维生素C，但茄红素等抗氧化物质反而增加。高温烹调能分解部分致敏蛋白，降低口腔刺痛感。肠胃敏感者更适合熟食，且熟椒甜味更明显，适合作为儿童辅食原料。快炒方式可兼顾营养保留与口感。
建议根据体质交替选择食用方式，健康人群可生熟搭配。生吃前用盐水浸泡去除农残，熟食避免长时间高温烹煮。搭配橄榄油或坚果能提升脂溶性营养素吸收，腹泻期间建议熟食，术后恢复期可制成椒泥食用。每日摄入量控制在100-150克为宜，特殊人群需遵医嘱调整。