生殖器疱疹后期可以通过抗病毒治疗、免疫调节、中药外敷等方法进行治疗。如果症状持续或加剧，建议患者及时就医。

1.抗病毒治疗

抗病毒治疗通常包括口服抗病毒药物如阿昔洛韦、伐昔洛韦等来抑制病毒复制。此方法通过减少病毒活跃性减轻病情严重程度，进而促进愈合过程。

2.免疫调节

免疫调节可通过使用干扰素、转移因子等药物增强机体免疫力。提高机体抵抗力有助于对抗病毒感染，辅助控制病情发展。

3.中药外敷

患者可遵医嘱将适量黄连、板蓝根等中药材捣碎后加水煎煮取汁液外敷于患处。中医认为上述药材具有清热解毒的功效，能够缓解局部不适症状。

此外，建议患者定期复查，监测病情变化，以便及时发现并处理任何复发或其他并发症。同时，保持良好的个人卫生习惯，避免过度疲劳和压力，也有助于减少生殖器疱疹的发作频率。