血清病毒PCR检查阴性不是梅毒。

血清病毒PCR检查主要是针对特定的病毒感染，而梅毒是由梅毒螺旋体引起的传染病，两者检测的是不同的病原体。因此，阴性结果意味着没有检测到目标病毒，而不是梅毒螺旋体。

如果患者在高度疑似感染梅毒的情况下进行了血清学检测，但结果显示为阴性，则可能是因为处于感染早期或存在假阴性结果。此时建议复查RPR、TP-ELISA等特异性较强的试验以确认诊断。

进行血清病毒PCR检查时，应避免在采样前24小时内使用抗生素或其他影响微生物活性的药物，以免干扰检测结果准确性。另外，在等待结果期间，患者可医生是否需要采取进一步的治疗措施。