卵巢囊肿是一种常见的妇科疾病，其病因目前尚不明确。如果患者发现有卵巢囊肿3.5cm的情况，则可能为生理性囊肿或病理性囊肿，是否严重需要根据具体情况而定。

一、生理性囊肿

通常情况下，生理性囊肿在1-2个月内会自行消失，此时病情并不严重，定期复查即可，如间隔1个月进行超声检查，以观察囊肿的生长情况。

二、病理性囊肿

1.良性囊肿：包括成熟性畸胎瘤和黏液性囊腺瘤等，此类囊肿一般不会发生恶变，但有可能对周围组织造成压迫，引起腹痛等症状。通过手术将囊肿完整剥除后，患者的预后较好，因此也不属于严重的病变。

2.交界性肿瘤：多数与遗传有关，常表现为单侧附件区囊肿，部分患者无明显症状，仅在体检时偶然发现，也有部分患者会出现下腹部不适、月经紊乱等表现。若未及时治疗，可能会出现恶性转化等情况，从而发展成卵巢癌，此时则较为严重。

3.恶性肿瘤：早期可无任何临床症状，随病情进展，逐渐出现下腹部隐痛、腰骶部疼痛以及阴道异常流血等症状。如果不及时治疗，也会向远处转移并危及生命，因此也属于比较严重的情况。

4.巧克力囊肿：即子宫内膜异位症形成的囊肿，随时间推移囊肿会逐渐增大，且容易复发，会对女性生育功能产生影响。如果没有生育要求，可以暂时不予处理，注意观察即可。如果有生育要求，需尽早行腹腔镜下异位病灶切除术，以免导致不孕。

对于卵巢囊肿3.5cm的患者，在日常生活中应注意个人卫生，勤换洗内衣裤，还应养成良好的生活习惯，避免熬夜，并遵医嘱定期复查。