卵巢囊肿手术的时间一般在1-6个小时不等。对于体积较小的生理性囊肿或良性囊肿，患者可能不需要进行手术治疗即可；而对于较大的病理性囊肿，则需要通过腹腔镜或开腹手术来切除，通常情况下此类手术所需时间较短。

一、无需手术

如果患者的卵巢囊肿为生理性囊肿，且囊肿体积较小，如直径＜5cm，并没有出现破裂或者扭转的情况，此时可暂时观察，多数患者经过一段时间后会自行消失，因此无需行手术治疗。

二、需手术

1.巧克力囊肿：是指发生于女性子宫内膜异位症，由于异位灶中的腺体分泌活动而形成含黏液血性的液体，即巧克力糊状液体积聚形成的囊肿，属于良性疾病。若囊肿体积未超过5cm，无明显临床症状时，可以先给予药物治疗，常用口服避孕药如复方炔诺酮片等，抑制排卵，减少月经出血量，从而延缓囊肿发展。但如果囊肿体积较大，建议采取腹腔镜下将囊肿切除的方法进行治疗，此种情况下的手术时间相对较短，约1-2小时即可完成。

2.畸胎瘤：是常见的生殖细胞肿瘤，大多发生于30岁以下的育龄妇女，临床上以一侧附件区扪及包块为主要表现，超声检查提示卵巢区内有无回声，其内有丰富的血管网。针对体积较小的畸胎瘤，如果没有产生压迫症状，也没有恶变倾向，也可以采用保守治疗方法，定期复查B超观察病情进展，大多数患者可以在半年左右的时间达到自愈的目的。但若畸胎瘤持续增大并伴有不适症状，应及时进行手术切除，手术时间取决于畸胎瘤的位置和大小，如果是单纯的畸胎瘤完整摘除术，大约需要1小时，若是恶性畸胎瘤则需要扩大范围切除，这种情况下所需要的时间相对长一些，可能需要4小时左右。

3.输卵管系膜囊肿：指发生在输卵管壶腹部的一种囊性病变，常因输卵管炎症引起，在妇科比较常见。若输卵管系膜囊肿较小，且患者没有明显的症状，也可能会自然消失，所以不用急于处理。但如果囊肿比较大，或是长期存在的情况下，应积极进行手术切除，手术时间根据具体操作方法有所不同，通常是1-2小时。

此外，还可能是卵巢癌导致，是一种恶性程度较高的上皮性肿瘤，发病原因尚不清楚，考虑与遗传、激素等因素有关。早期患者主要表现为下腹部隐痛不适、盆腔包块等症状，随着病情的发展，患者还会伴随消瘦、乏力、发热以及阴道异常流血等情况。一旦确诊为卵巢癌，应该尽早进行手术治疗，如全子宫加双侧附件切除术、部分子宫加双侧附件切除术等，手术时间根据具体情况不同而有所差异，一般是1-6小时。