大部分情况下，女性在进行卵巢囊肿手术之后可以怀孕。但部分特殊类型的卵巢囊肿可能会影响生育功能，如巧克力囊肿、畸胎瘤等，在这种情况下可能不会怀孩子。

如果是在做妇科彩超时发现有生理性卵巢囊肿，并且直径＜5cm，通常会在2-3个月内自行消失。如果是良性卵巢囊肿，比如畸胎瘤或者是巧克力囊肿，一般做完手术之后不影响怀孕，因为这两种囊肿是长在卵巢上的肿瘤，与正常的卵巢组织并无关系。因此只要保留了患者的生育能力，患者就可以正常怀孕，而且也不会影响胎儿的生长发育。

但如果是因为患有恶性卵巢囊肿而做的手术，则可能会对女性的生育造成一定的影响。因为在进行恶性卵巢囊肿切除术的过程中，会尽量将囊肿完整地摘除，但是由于恶性程度较高，所以术后复发率也比较高。此时就有可能会导致盆腔粘连的情况出现，从而引起输卵管堵塞或者积水的现象发生，导致不孕不育或异位妊娠的发生概率增加。所以在这种情况下，女性怀孩子的几率就会降低。

综上所述，大多数情况下，卵巢囊肿手术后是可以怀孩子的，但是如果存在特殊情况，也可能会影响生育情况。建议患者及时就医明确自身情况，必要时可遵医嘱选择合适的方法治疗，以促进恢复。