1.药物的副作用大。药物流产的副作用大，主要是导致女性的内分泌失调，造成卵巢功能异常。另外根据医学研究调查，也有不少女性在进行药物流产时，突发死亡。

2.二次清宫伤害大。女性药物流产后，若是子宫腔内的胚囊组织排出不全，体内的残留组织会危及到女性的生命安全，严重时，会出现血崩，这就需要再次进行刮宫清理。

3.并发感染几率高。女性在进行药物流产后，在不同程度上都会女性的子宫造成一定的损伤，甚至是导致阴道出血，而长期的阴道出血，极易的受到细菌的入侵，导致生殖道感染，引发生殖道疾病，常见的有宫颈炎、盆腔炎或是阴道炎等。