马齿苋具有清热解毒、凉血止血、止痢等药用价值，常用于治疗热毒血痢、痈肿疔疮、湿疹等病症。
1、清热解毒
马齿苋性寒味酸，归肝、大肠经，能有效清除体内热毒。对于热毒引起的咽喉肿痛、口舌生疮等症状，可用鲜品捣汁含漱或外敷。其含有的去甲肾上腺素样物质能帮助抑制多种致病菌生长，对金黄色葡萄球菌、痢疾杆菌等有明显抑制作用。
2、凉血止血
马齿苋富含维生素K和鞣质，能增强毛细血管收缩力，缩短凝血时间。适用于血热妄行导致的鼻衄、咯血、便血等症状，可配伍地榆炭、侧柏叶等药材增强疗效。鲜品捣烂外敷还能缓解外伤出血。
3、止痢消炎
马齿苋对细菌性痢疾、急性肠炎有显著疗效，其黏液质能保护肠黏膜，生物碱成分可抑制肠道致病菌。治疗湿热痢疾时可与黄连、黄芩配伍，或单用鲜品煎汤服用。现代研究证实其提取物对志贺氏菌、沙门氏菌有抑制作用。
4、利水消肿
马齿苋含丰富钾盐及黄酮类化合物，能促进钠离子排泄，改善水肿症状。对湿热下注引起的小便不利、下肢浮肿，可用鲜品60克煎服。与车前草、玉米须配伍可增强利尿效果。
5、护肤疗疮
马齿苋所含ω-3脂肪酸和维生素A能促进皮肤修复，鲜品捣敷可治疗带状疱疹、丹毒等皮肤热毒病症。煎汤外洗对湿疹、荨麻疹等过敏性皮肤病有止痒效果，与苦参、白鲜皮同用效果更佳。
使用马齿苋时建议选择叶片肥厚、茎秆紫红色的新鲜植株，脾胃虚寒者应慎用。可凉拌、做馅或煮粥食用，每日鲜品用量不超过100克。药用需配伍其他中药材时应在医师指导下进行，孕妇及便溏者禁用。采收时注意避开污染源，使用前需用淡盐水浸泡清洗。