扁平疣服用中药的疗程通常需要1-3个月，具体时间与疣体大小、体质差异、药物配伍等因素相关。扁平疣是由人乳头瘤病毒感染引起的皮肤良性赘生物，中医认为多因气血失和、外感毒邪所致。
中药治疗扁平疣主要通过内服清热解毒、活血化瘀的方剂，如马齿苋合剂、桃红四物汤加减等。初期疣体较小且数量少者，连续用药4-6周可见疣体萎缩；病程较长或疣体融合成片者，需坚持用药2个月以上。治疗期间疣体可能出现发红、脱屑等排毒反应，属正常现象。
部分特殊体质患者对药物吸收较慢，或合并其他慢性疾病时，疗程可能延长至4-5个月。若用药3个月后疣体无明显变化，需调整方剂或结合火针、艾灸等外治法。孕妇、过敏体质者应在医师指导下减量使用。
治疗期间应保持皮肤清洁干燥，避免搔抓疣体。饮食宜清淡，少食海鲜、辛辣刺激之物，可适量食用薏苡仁、绿豆等利湿解毒的食材。配合规律作息和适度运动有助于气血运行，加速疣体消退。需定期复诊观察疗效，不可自行中断用药。