陈皮长期保存需避光防潮密封，可采用干燥保存、冷藏保存、真空保存、罐装保存、晒干保存等方法。
1、干燥保存
将陈皮置于阴凉通风处自然晾干，避免阳光直射。干燥环境能有效防止霉变，保持陈皮原有香气。定期翻动确保均匀干燥，湿度较高时可放置食品干燥剂辅助吸潮。此法适合气候干燥地区使用，保存期可达一年以上。
2、冷藏保存
用保鲜袋密封后放入冰箱冷藏室，温度控制在4℃左右。低温环境可延缓陈皮氧化速度，保持油胞活性成分。注意密封前需确保陈皮完全干燥，避免结霜受潮。此法适合南方潮湿地区，保存期约两年，取出使用时需回温至室温。
3、真空保存
采用食品级密封袋抽真空处理，隔绝氧气和水分。真空状态能最大限度保留陈皮挥发油成分，防止香气流失。建议分装成小份量真空包装，避免反复开封。此法保存期可达三年以上，适合高品质陈皮的长期储藏。
4、罐装保存
选择陶瓷或玻璃密封罐，底层铺放生石灰或木炭吸湿。每层陈皮间用宣纸隔开，罐口用蜂蜡密封。传统罐装法能使陈皮缓慢陈化，提升药用价值。注意每半年检查更换吸湿材料，此法保存的陈皮随时间增长品质更佳。
5、晒干保存
每年夏季选择连续晴天暴晒3-5天，紫外线可杀菌防虫。晒后趁热装入棉布袋悬挂于通风处，利用昼夜温差促进陈化。此法遵循传统"三蒸三晒"工艺原理，适合大批量保存，但需注意防尘防鼠。
陈皮保存期间需定期检查有无虫蛀霉变，优质陈皮应呈棕红色且有浓郁香气。日常取用后要及时密封，避免接触油脂和异味。可与糯米、花椒等天然防虫材料共同存放，五年以上老陈皮药用价值更高。若发现表面出现白霜属正常现象，为柑橘类结晶物而非霉变，用软刷轻拭即可。