慢性细菌性前列腺炎的发病原因，目前能够明确的有以下几种：
(1)急性炎症病变严重或未予彻底治疗而转为慢性细菌性前列腺炎。
(2)急性尿路感染未治愈而蔓延为慢性细菌性前列腺炎。
(3)邻近病变经淋巴途径蔓延至前列腺发生慢性细菌性前列腺炎。
(4)性交过频、前列腺充血、下尿路梗阻或炎症、会阴及尿道损伤后诱发慢性细菌性前列腺炎。
(5)全身其他部位病灶经血行感染影响前列腺而导致慢性细菌性前列腺炎。(6)其他原因如前列腺增生和前列腺肿瘤时也可合并感染。
其中，尿道炎直接蔓延是引起慢性细菌性前列腺炎的主要途径。
在病理上，慢性细菌性前列腺炎表现为慢性局限性病变，多见于一条腺管或一部分腺泡发生炎症改变。与急性前列腺炎相比炎症反应较轻，常无特异性改变，可见管腔扩大，内有自细胞及其分泌物。基质内可见散在的中性粒细胞、淋巴细胞、浆细胞浸润。前列腺管腔内可找到前列腺结石，主要成分为磷灰石，结石中心可有细菌。