无痛肠镜是通过静脉麻醉辅助下完成的内窥镜检查，主要流程包括肠道准备、麻醉诱导、内镜插入与观察、组织取样或治疗操作、苏醒观察五个步骤。
检查前1-3天需低渣饮食，检查当日服用复方聚乙二醇电解质散等清肠剂排空肠道。麻醉医师会通过静脉注射丙泊酚等短效麻醉药物使受检者进入睡眠状态。医生将带有摄像头的肠镜从肛门缓慢推进至回盲部，实时观察结直肠黏膜是否存在息肉、溃疡或肿瘤等病变。发现可疑病灶时可使用活检钳取样，或直接进行内镜下黏膜切除术等治疗操作。检查结束后受检者需在复苏室观察30-60分钟，待麻醉完全消退且无出血、腹痛等并发症方可离院。
检查后2小时内禁止进食饮水，24小时内避免驾驶或高空作业等精细操作。日常应保持膳食纤维摄入，限制辛辣刺激食物，40岁以上人群建议每3-5年定期筛查。若出现持续腹痛、便血或发热等症状需立即返院复查。肠道准备期间可饮用透明糖盐水预防脱水，糖尿病患者需提前调整降糖方案。