体检机构和医院的检查准确性需根据具体项目类型和机构资质综合判断。专业医疗设备齐全的三甲医院在疾病诊断类项目上更具权威性，而标准化体检机构在常规筛查项目上同样可靠。
医院检验科通常配备更精密的检测设备，如核磁共振仪、基因测序仪等高端仪器，且由临床经验丰富的医师操作。对于肿瘤标志物检测、病理活检等复杂项目，医院实验室通过ISO15189认证的比例较高，检测流程严格遵循医疗质量控制标准。部分三甲医院还承担科研任务，能够开展特殊项目的检测。
专业体检机构在基础项目检测上具有优势，如血常规、尿常规等常规检查使用全自动流水线设备，批量检测的标准化程度高。大型连锁体检中心会定期进行设备校准和人员培训，部分项目与第三方医学实验室合作。对于入职体检、健康证办理等标准化需求，体检机构的效率通常更高。
建议根据实际需求选择检测机构。重大疾病排查或异常指标复查应优先选择医院，常规年度体检可选择资质齐全的体检中心。无论选择哪种机构，都应确认其具备医疗机构执业许可证，检验科室通过室间质评，并保留完整检测报告以备后续就医参考。体检后发现异常指标时，需及时到医院专科进行复核诊断。