枇杷熬水一般不需要去皮，但需彻底清洗并去核。枇杷皮含有丰富的膳食纤维和抗氧化成分，熬煮后有助于增强润肺止咳效果。若担心农药残留或口感粗糙，去皮熬制亦可。
枇杷皮在传统食疗中常被保留，因其含有柚皮苷等活性物质，能协同果肉发挥更好的化痰作用。新鲜枇杷表皮绒毛较多，建议用盐水浸泡后以流水反复搓洗，可有效去除表面杂质。带皮熬煮时需注意火候，文火慢炖20分钟能使皮中有效成分充分释放，汤汁呈现琥珀色为佳。
部分特殊情况下建议去皮处理。消化功能较弱的人群，去皮可减少粗纤维对胃肠黏膜的刺激；婴幼儿饮用时去皮更安全，避免绒毛引发咽喉不适。若枇杷表皮有明显机械损伤或霉斑，必须去除病变部位再熬煮。市售枇杷若为保鲜打蜡，建议削皮后使用。
熬制枇杷水时可搭配适量冰糖或蜂蜜增强滋润效果，但糖尿病患者应控制添加量。建议选择成熟度高的新鲜枇杷，避免使用青果以免果酸过多刺激胃部。日常饮用每周不超过3次，连续饮用不宜超过7天，若咳嗽症状未缓解应及时就医。风寒咳嗽者慎用枇杷水，避免寒凉加重症状。