内酯豆腐可以直接撕开包装盒顶部的塑料薄膜或剪开盒角倒出。内酯豆腐质地柔软易碎，开盒时需避免挤压变形，可采用热水浸泡盒身、倒扣脱模等方法保持完整。
内酯豆腐采用葡萄糖酸内酯作为凝固剂，其含水量高且结构脆弱，传统开盒方式容易导致碎裂。将未开封的豆腐盒浸泡在60度左右温水中约30秒，热量会使盒内空气膨胀产生轻微压力，此时撕开顶部薄膜可轻松倒出完整豆腐块。另一种方法是用剪刀沿盒体对角线剪开两个小孔，空气进入后倒扣在盘中，轻拍盒底让豆腐自然滑落。操作时需注意水温不可过高以免影响豆腐口感，倒扣动作要缓慢平稳。
部分内酯豆腐包装设计有易撕口，沿标识线撕开即可。若需切块食用，建议将豆腐连盒静置10分钟沥去多余水分，用刀划开盒内豆腐时更不易粘连。开封后未食用部分应浸没于凉开水中冷藏保存，每日换水可延长保鲜期至3天。豆腐接触金属器具易氧化发酸，建议使用陶瓷或塑料刀具处理。
日常存放内酯豆腐应保持包装完整直立放置，避免冷冻导致质地海绵化。烹饪前半小时取出恢复室温，凉拌时可用重物轻压脱水提升口感。搭配海鲜或菌菇类食材能提高蛋白质利用率，胃肠功能较弱者建议加热后食用以减轻消化负担。