柠檬短期保存可放常温，长期保存建议放冰箱。柠檬的保存方式主要取决于存放时间、环境温度及用途需求。
常温保存适合短期内食用的柠檬，室温通风环境能保留更多香气物质，果皮不易因低温失水变硬。厨房阴凉处存放不超过一周为宜，避免阳光直射导致维生素C氧化。切开后的柠檬需用保鲜膜包裹切面，减少与空气接触。常温保存的柠檬更适合直接切片泡水或榨汁，风味更接近自然成熟状态。
冰箱冷藏可延长柠檬保鲜期至一个月左右，低温环境能抑制霉菌滋生。建议用保鲜袋密封后置于蔬果冷藏区，温度控制在4-8摄氏度为宜。整颗冷藏的柠檬使用前需室温回温半小时，避免低温影响汁液渗出。需注意冷藏可能导致果皮表面出现褐色冻斑，虽不影响食用但会降低美观度。冷冻保存的柠檬虽可存放更久，但解冻后果肉会软化，仅适合用于烹饪调味。
无论选择哪种保存方式，都应挑选表皮完好无凹陷的柠檬。保存前无须水洗，潮湿环境易加速腐烂。若发现果皮发黏或出现霉斑应立即丢弃。日常可将柠檬与苹果香蕉等水果分开放置，避免乙烯气体催熟。根据使用需求灵活选择保存方式，既能保证食用安全又能最大限度保留营养风味。