豆腐可以冷藏保存，但不宜长时间冷冻。豆腐的保存方式主要取决于保存时间、豆腐种类及后续用途，新鲜豆腐建议冷藏并在2-3天内食用，若需长期保存可冷冻但口感会改变。
豆腐含有较高水分，冷藏可延缓变质但需浸泡在干净水中并每日换水，防止酸败。冷藏温度应控制在4℃以下，密封保存避免串味。嫩豆腐比老豆腐更易变质，开封后需尽快食用。若发现表面发黏或酸味则不可再食用。
冷冻会使豆腐内部水分结晶，解冻后质地变松散多孔，适合炖煮或煎炸但凉拌口感差。冻豆腐需切块分装避免粘连，冷冻可保存1个月左右。北豆腐因含水量低比南豆腐更适合冷冻，但仍有明显蜂窝状结构。反复冻融会加速营养流失。
日常建议按需购买新鲜豆腐，冷藏保存及时食用。若制作冻豆腐，可提前沥干水分并切块分装，用于火锅或炖菜能更好吸收汤汁。避免将豆腐与气味强烈的食物同放，防止交叉污染。特殊人群如胃肠敏感者应选择新鲜豆腐，减少冷冻食品摄入。