洗好的花菜在冰箱冷藏条件下通常可以保存3-5天。花菜的保存时间主要受储存温度、湿度、预处理方式、密封程度以及新鲜度等因素影响。
花菜清洗后水分残留会加速腐败，建议用厨房纸吸干表面水分后放入保鲜袋密封冷藏。若花菜已切分或焯水处理，需在2天内食用完毕，因细胞结构破坏后更易滋生细菌。冷藏温度需控制在0-4摄氏度，湿度保持在较高水平可延缓萎蔫。观察花菜出现发黄、软烂或异味时不可继续食用。
未清洗的完整花菜在冷藏条件下可存放7天左右，但清洗会破坏表面保护层。若需延长保存时间，可将花菜分装冷冻，但解冻后口感会变软，适合用于炖煮类菜肴。冷冻保存时需先焯水1-2分钟，晾凉后分装密封，可保存8-12个月。注意冷冻花菜不宜反复解冻，建议按需分装小份量。
日常储存花菜时建议保留部分茎叶包裹，有助于锁住水分。烹饪前再清洗可最大限度保持新鲜度，处理时使用干净刀具和案板避免交叉污染。花菜富含维生素C和膳食纤维，建议新鲜食用以获取最佳营养价值，长期存放可能导致营养流失。若发现花菜表面出现黑斑或霉点，即使局部变质也应当整颗丢弃。