干蘑菇存放6年通常不建议食用，可能存在霉变或营养流失风险。干蘑菇的保质期受储存环境、包装方式、品种差异等因素影响，超过常规保存期限后食用安全性无法保证。
干蘑菇在干燥通风环境下密封保存时，一般可维持12-24个月的食用价值。水分含量低于10%的优质干品，在真空包装且避光条件下或可延长保存期，但随时间推移，其风味物质会逐渐挥发，蛋白质可能发生变性，维生素B族等热敏性营养素大量损耗。若储存期间受潮或接触空气，更易滋生黄曲霉菌等有害微生物，产生肉眼不可见的毒素。
极少数未经开封的冻干工艺蘑菇制品，在恒温恒湿的专业仓储条件下，6年后或能保留部分食用价值。但家庭储存很难满足这类严苛条件，且长期存放后即便无霉变，口感也会显著下降，鲜味物质呈味核苷酸分解率可达80%以上。部分木质化严重的菌柄还可能产生难消化纤维，增加胃肠负担。
建议优先食用保质期内的干制菌类，长期存放的干蘑菇若出现异味、虫蛀或霉斑必须丢弃。日常储存应使用密封罐配合食品干燥剂，置于阴凉避光处，开封后建议分装冷冻保存。食用前需充分泡发并观察水质是否浑浊，炖煮时需保证中心温度达到100℃并持续15分钟以上以降低潜在风险。