金桔表面有蜡主要是为了保鲜和提升外观品质。金桔表皮的自然蜡质与人工食用蜡是两种常见来源，前者是果实自身分泌的保护层，后者为运输储存中添加的合规食品级涂层。
金桔表皮会自然形成一层薄蜡质，属于植物生理现象。这层天然蜡质由脂肪酸、醇类等成分构成，能减少水分蒸发、防止病菌侵入，帮助果实适应环境变化。采摘后部分果农会喷洒食用级棕榈蜡或虫胶，这类食品添加剂可填补表皮微孔，延缓氧化腐败，同时增强果面光泽度。我国允许使用的果蜡需符合食品安全标准，主要成分为天然动植物蜡，正常清洗即可去除。
极少数情况下，劣质工业蜡可能被违规使用。此类蜡可能含重金属或矿物油成分，但通过正规渠道购买的金桔通常无须担心。挑选时可用纸巾轻擦表面，天然蜡质不易脱落，人工蜡会有轻微油光；用温水浸泡后搓洗，或使用果蔬清洁剂，能有效去除表面蜡层。
日常食用金桔前建议用流水冲洗30秒，辅以软毛刷轻刷表面。若对蜡质敏感可去皮食用，但果皮中维生素C和膳食纤维含量较高，适量食用带皮金桔更有助于营养摄入。储存时保持干燥通风，避免高温潮湿环境导致蜡层黏连果肉。