长期饮用净化器净化后的水通常是安全的，但需结合水质情况与净化器类型综合判断。家用净水器可有效去除水中杂质、重金属及部分微生物，但过度过滤可能损失矿物质，且滤芯维护不当可能造成二次污染。
采用反渗透技术的净水器能深度净化水质，适合重金属污染严重的地区，但长期饮用可能减少钙、镁等矿物质的摄入。活性炭滤芯对氯气、有机物吸附效果显著，但需定期更换以避免细菌滋生。超滤净水器保留部分矿物质，但对溶解性污染物去除能力有限。部分地区自来水中本就含有适量矿物质，过度净化反而不利于营养均衡。滤芯超期使用会导致过滤效能下降，甚至释放已吸附的污染物。
某些特殊情况下需谨慎。免疫功能低下人群若使用灭菌不彻底的净水器，可能增加感染风险。长期单一饮用纯净水且饮食不均衡者，可能出现矿物质缺乏。老旧管道供水区域若净水器未配备抑菌设计，储水罐易成为微生物温床。工业污染区若净水器未针对性配置特殊滤芯，仍可能存在化学污染物残留。
建议根据当地水质报告选择匹配的净水设备，优先选择保留有益矿物质的过滤技术。定期检测净化后水质，严格按说明更换滤芯。日常可交替饮用净化水与矿泉水，通过牛奶、豆制品等食物补充矿物质。注意观察身体反应，如出现乏力、抽筋等疑似矿物质缺乏症状，应及时就医评估。