柠檬泡在蜂蜜里一般能存放1-3个月，具体时间与容器密封性、环境温度、食材新鲜度等因素有关。
蜂蜜本身具有抑菌作用，柠檬的酸性环境也能延缓变质。将新鲜柠檬切片后完全浸没在蜂蜜中，密封冷藏保存可延长存放时间。使用干燥洁净的玻璃罐避免污染，每次取用时用无水无油的工具可减少细菌侵入。若蜂蜜出现气泡、酸味或柠檬发霉变色则需立即丢弃。
室温存放时因温度波动易加速发酵，建议控制在20天以内。蜂蜜可能出现结晶属正常现象，但若液体分层浑浊则可能变质。糖尿病患者及胃肠敏感者应谨慎食用，避免过量摄入糖分或刺激胃肠黏膜。日常建议分装小份冷藏，随取随用以保证新鲜度。