豆腐在冰箱冷藏室一般可保存2-3天，冷冻保存可延长至1个月。实际保存时间受豆腐种类、包装状态、储存温度等因素影响。
新鲜未开封的嫩豆腐冷藏保存时间较短，需在2天内食用完毕。这类豆腐水分含量高，蛋白质易滋生细菌，若包装出现胀袋或豆腐发黏、变酸则不可食用。老豆腐因含水量较低且质地紧密，未开封冷藏可存放3天左右，但表面若出现淡黄色黏液或霉斑需丢弃。真空包装的灭菌豆腐在未拆封时冷藏保质期可达7天，但开封后仍需按普通豆腐处理。
将豆腐切块后浸泡于每日更换的凉开水中，可延缓变质1-2天，但水中需添加少量盐抑制微生物繁殖。冷冻保存会使豆腐形成蜂窝状结构，适合用于炖煮料理，解冻后需挤干水分再烹调。需注意豆腐与生肉海鲜分开存放，避免交叉污染，且冷藏温度应保持在4℃以下。
建议购买后尽快食用以保留最佳口感，储存时保留原包装或使用密封容器。若需长期保存，可将豆腐分装冷冻，烹调前无需解冻直接入菜。定期清洁冰箱隔层，避免豆腐吸收其他食物异味，出现异常气味或颜色变化时应立即丢弃。