芥菜一般需要煮3-5分钟至熟透，具体时间根据叶片老嫩、切分大小及烹饪方式调整。
芥菜叶片较薄且质地脆嫩，沸水下锅后中火煮3分钟左右即可断生，此时叶片颜色转为深绿、茎部稍透明为最佳口感。若整棵烹饪或茎部较粗，可延长至5分钟确保茎部熟透，但不宜超过8分钟以免维生素C等水溶性营养素流失过多。使用蒸制方式时需延长至8-10分钟，蒸汽穿透力较弱但能更好保留芥子油苷等活性物质。
冷冻芥菜或老叶较多的品种需预先焯水1分钟去除苦涩味，再正式烹饪2-3分钟。采用高压锅快速焖煮时，上汽后1-2分钟即可关火，利用余热焖至全熟能最大限度保持脆嫩度。观察熟度时可夹取茎部用筷子轻戳，能轻松穿透且无硬芯即为熟透标准，过度烹煮会导致叶片软烂、硫苷类物质分解产生不良风味。
建议烹饪前将芥菜洗净后撕成适口大小，茎部可斜切薄片加速受热，水中加少量食盐或食用油有助于保持翠绿色泽。搭配豆腐、香菇等食材同煮时，需先将配料煮至半熟再下芥菜，避免久煮破坏营养。胃肠敏感者可将芥菜预先快速焯水减少刺激性，保留更多营养的同时提升消化适应性。